D'après un article du monde du 16 novembre 2009, "La France a plus de 6 millions d'obèses". L'obésité est donc un sujet d'actualité car le nombre d'individus touchés augmente chaque année  de façon inquiétante. 
      
Nous avons découvert avec l'expérience de Jeffrey Gordon que le microbiote avait un lien avec l'obésité. Nous avons donc décidé d'étudier ce lien.

      De plus ce sujet interroge encore beaucoup les chercheurs. On ne pourra donc pas donner de conclusion définitive car le sujet reste controversé.

    
L'équipe américaine de Jeffrey Gordon de l'université Washington à Saint Louis a commencées des études en 1980 sur des souris afin de savoir s'il existe un lien entre le microbiote et l'obésité. Ils utilisent des souris axéniques (souris ne possédants pas de microbiote), celles-ci sont prélevées stérilement in utero puis placées dans un milieu stérile, elles sont nourries avec des aliments stériles. L'équipe a constaté que les souris normales mangeaient moins que les souris axéniques et que pourtant elles avaient 60% de masse grasse supplémentaire. Donc le microbiote a une influence sur la prise de poids. Ils ont aussi transféré le microbiote de souris normales dans des souris axéniques. Leur masse grasse a augmenté de 60% dans les deux semaines qui ont suivi le transfert. Une expérience antérieure avait montré que la présence du microbiote favorisait le développement du réseau sanguin autour de l'intestin. Ce qui expliquerait que l'énergie extraite des aliments serait plus facilement assimilée.

Le microbiote des souris obèses semble plus efficaces que celui des souris minces pour assimiler l'énergie.

 

On ne sait pas, par contre, si la modification de rapport est la cause ou la conséquence de l'obésité.

Deux expériences, aux résultats contradictoires, ont été menées. Cette équipe a suivi pendant un an, en 2006, dix-sept volontaires, dont douze obèses et cinq minces en étudiant leur flore intestinale. Celle des obèses présentait un déficit de 90% des bacteriodetes et un surplus de firmicutes supérieur à 20%. Cette différence conduirait à une élévation de la quantité de sucres extraits de la nourriture.
Puis les personnes obèses ont perdues 20% de poids. En perdant du poids, la quantité de Bacteroidetes a augmenté. Au début du régime le rapport Firmicutes / Bacteroidetes était à 95/5 puis est passé à 70/30 (rapport proche de celui des personnes „minces“). Ce rapport commence à changer à partir d'une perte de poids de 6%. 

Dans le premier cas, c'est le microbiote déréglé qui est responsable de la variation du poids alors que dans la seconde expérience, c'est la variation du poids qui entraine une modification des rapports firmicutes/bacteroidetes dans le microbiote.